Le zonisamide étant un faible inhibiteur de la P-gp (MDR1) avec une CI50 de 267 µmol/l - pourrait théoriquement affecter la pharmacocinétique des substances qui sont des substrats de la P-gp. Il est recommandé d'être prudent dans les associations du zonisamide avec ces substances dont la digoxine ou la quinidine (lors de l'instauration ou de l'arrêt du traitement par le zonisamide ou d'une modification de la dose de zonisamide).
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